按照《中華人民共和國中外合作辦學條例》的規定：中外合作辦學通常是指外國教育機構同中國教育機構在中國境内合作舉辦的以中國公民為主要招生對象的教育機構或項目的活動。目前，學校擁有教育部批準的中外合作辦學項目3個：
項目名稱 | 辦學層次 | 獲批時間 | 畢業 人數 | 備注 |
南航-倫敦城市大學自動化(航空電子與控制)本科中外合作辦學項目 | 本科 | 2011 | / | 江蘇省第二批中外合作辦學高水平示範性建設工程（2017） |
南航-澳大利亞皇家墨爾本理工大學（交通運輸）本科中外合作辦學項目 | 本科 | 2012 | / | 江蘇省第二批中外合作辦學高水平示範性建設工程（2016） |
南航-英國克蘭菲爾德大學航空制造(航空工程)專業碩士研究生教育項目 | 碩士 | 2018 | / | 2019年開始招生 |
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